Sytuacja w kraju jest bardzo niestabilna. Brakuje podstawowych usług, a katastrofy naturalne, takie jak silne powodzie, co roku dotykają jego mieszkańców. Szacuje się, że pomocy potrzebuje prawie ⅔ mieszkańców Sudanu Południowego. Wiele osób przenosi się w inne części kraju lub poza jego granice w poszukiwaniu bezpiecznego schronienia, żywności i wody. Obecnie 2 mln osób to uchodźcy wewnętrzni, a kolejne 2,29 mln przebywa w innych państwach jako uchodźcy.
Konflikty, wymuszone przemieszczenia oraz powodzie i epidemie, których doświadcza Sudan Południowy, utrudniają produkcję żywności. W kraju otrzymuje się krytyczny poziom niedożywienia oraz poważny brak bezpieczeństwa żywnościowego, który dotyka 7,1 mln osób. Aż 1,7 mln dzieci cierpi z powodu ostrego niedożywienia.
Powodzie zniszczyły infrastrukturę wodno-sanitarną – dostęp do czystej wody i toalet jest bardzo utrudniony. Takie warunki zwiększają ryzyko wybuchu epidemii chorób przenoszonych drogą wodną.
